Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTCH1Q13635 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTCH1Q13635 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTCH1Q13635 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTCH1Q13635 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTCH1Q13635 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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