Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
KRR1Q13601 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.4□□□□□ -2.95
KRR1Q13601 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
KRR1Q13601 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
KRR1Q13601 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
KRR1Q13601 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
KRR1Q13601 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
KRR1Q13601 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
KRR1Q13601 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.55□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
KRR1Q13601 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KRR1Q13601 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
KRR1Q13601 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
KRR1Q13601 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
KRR1Q13601 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
KRR1Q13601 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
KRR1Q13601 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.69□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
KRR1Q13601 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
KRR1Q13601 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms