Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ATMQ13315 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ATMQ13315 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
ATMQ13315 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
ATMQ13315 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
ATMQ13315 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
ATMQ13315 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
ATMQ13315 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ATMQ13315 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ATMQ13315 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ATMQ13315 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ATMQ13315 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
ATMQ13315 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ATMQ13315 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ATMQ13315 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ATMQ13315 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
ATMQ13315 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
ATMQ13315 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-4.31□□□□□ -3.1
ATMQ13315 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ATMQ13315 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ATMQ13315 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ATMQ13315 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
ATMQ13315 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
ATMQ13315 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
ATMQ13315 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
ATMQ13315 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
ATMQ13315 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
ATMQ13315 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ATMQ13315 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ATMQ13315 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ATMQ13315 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ATMQ13315 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-4.38□□□□□ -3.11
ATMQ13315 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
ATMQ13315 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
ATMQ13315 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
ATMQ13315 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
ATMQ13315 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
ATMQ13315 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
ATMQ13315 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
ATMQ13315 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
ATMQ13315 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
ATMQ13315 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
ATMQ13315 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
ATMQ13315 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
ATMQ13315 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
ATMQ13315 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
ATMQ13315 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
ATMQ13315 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
ATMQ13315 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
ATMQ13315 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
ATMQ13315 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
ATMQ13315 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
ATMQ13315 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
ATMQ13315 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
ATMQ13315 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
ATMQ13315 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
ATMQ13315 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.52□□□□□ -3.13
ATMQ13315 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
ATMQ13315 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
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