Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CD40LGP29965 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CD40LGP29965 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CD40LGP29965 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CD40LGP29965 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CD40LGP29965 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CD40LGP29965 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CD40LGP29965 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
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