Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
MEIS3Q99687 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
MEIS3Q99687 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
MEIS3Q99687 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
MEIS3Q99687 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
MEIS3Q99687 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms