Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC47Q96A33 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC47Q96A33 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CCDC47Q96A33 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CCDC47Q96A33 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.73□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CCDC47Q96A33 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CCDC47Q96A33 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CCDC47Q96A33 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CCDC47Q96A33 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CCDC47Q96A33 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CCDC47Q96A33 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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