Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.38□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
VAMP3Q15836 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
VAMP3Q15836 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3.5□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.51□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
VAMP3Q15836 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
VAMP3Q15836 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
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