Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SURF1Q15526 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SURF1Q15526 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SURF1Q15526 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SURF1Q15526 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SURF1Q15526 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms