Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SHHQ15465 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SHHQ15465 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHHQ15465 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHHQ15465 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHHQ15465 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHHQ15465 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHHQ15465 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHHQ15465 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHHQ15465 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHHQ15465 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHHQ15465 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHHQ15465 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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SHHQ15465 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHHQ15465 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHHQ15465 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHHQ15465 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHHQ15465 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHHQ15465 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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SHHQ15465 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHHQ15465 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHHQ15465 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SHHQ15465 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SHHQ15465 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SHHQ15465 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SHHQ15465 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SHHQ15465 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SHHQ15465 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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SHHQ15465 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SHHQ15465 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SHHQ15465 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SHHQ15465 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SHHQ15465 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SHHQ15465 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SHHQ15465 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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