Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RBM39Q14498 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RBM39Q14498 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RBM39Q14498 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RBM39Q14498 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RBM39Q14498 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RBM39Q14498 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RBM39Q14498 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
RBM39Q14498 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.9 ms