Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1CQ13936 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1CQ13936 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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