Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SNX1Q13596 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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SNX1Q13596 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SNX1Q13596 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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SNX1Q13596 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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SNX1Q13596 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNX1Q13596 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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SNX1Q13596 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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SNX1Q13596 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
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SNX1Q13596 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
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SNX1Q13596 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNX1Q13596 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNX1Q13596 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
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SNX1Q13596 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SNX1Q13596 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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