Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms