Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATRQ13535 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATRQ13535 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATRQ13535 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATRQ13535 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATRQ13535 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATRQ13535 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATRQ13535 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATRQ13535 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATRQ13535 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATRQ13535 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATRQ13535 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATRQ13535 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATRQ13535 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATRQ13535 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATRQ13535 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATRQ13535 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATRQ13535 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATRQ13535 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATRQ13535 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATRQ13535 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATRQ13535 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATRQ13535 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATRQ13535 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATRQ13535 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATRQ13535 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATRQ13535 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATRQ13535 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATRQ13535 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATRQ13535 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATRQ13535 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATRQ13535 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATRQ13535 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATRQ13535 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATRQ13535 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATRQ13535 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATRQ13535 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATRQ13535 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATRQ13535 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATRQ13535 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATRQ13535 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATRQ13535 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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