Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMOD1P28289 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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TMOD1P28289 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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TMOD1P28289 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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TMOD1P28289 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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TMOD1P28289 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
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TMOD1P28289 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMOD1P28289 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TMOD1P28289 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TMOD1P28289 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TMOD1P28289 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
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