Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SGCEO43556 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SGCEO43556 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SGCEO43556 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SGCEO43556 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SGCEO43556 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SGCEO43556 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SGCEO43556 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SGCEO43556 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SGCEO43556 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SGCEO43556 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SGCEO43556 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SGCEO43556 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SGCEO43556 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SGCEO43556 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SGCEO43556 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SGCEO43556 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SGCEO43556 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SGCEO43556 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SGCEO43556 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SGCEO43556 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SGCEO43556 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SGCEO43556 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SGCEO43556 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SGCEO43556 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SGCEO43556 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
SGCEO43556 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SGCEO43556 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SGCEO43556 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SGCEO43556 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms