Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBQLN4Q9NRR5 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBQLN4Q9NRR5 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
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