Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.3 ms