Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRNQ16849 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms