Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
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PTPRNQ16849 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRNQ16849 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRNQ16849 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PTPRNQ16849 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PTPRNQ16849 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRNQ16849 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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PTPRNQ16849 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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PTPRNQ16849 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRNQ16849 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRNQ16849 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRNQ16849 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PTPRNQ16849 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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PTPRNQ16849 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTPRNQ16849 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRNQ16849 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRNQ16849 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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