Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NEDD8Q15843 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
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NEDD8Q15843 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
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NEDD8Q15843 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
NEDD8Q15843 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
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