Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC3Q15034 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC3Q15034 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HERC3Q15034 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC3Q15034 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC3Q15034 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC3Q15034 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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