Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN5AQ14524 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCN5AQ14524 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN5AQ14524 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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