Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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