Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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GTF3C1Q12789 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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GTF3C1Q12789 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GTF3C1Q12789 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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GTF3C1Q12789 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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