Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PTPRMP28827 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
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PTPRMP28827 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
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PTPRMP28827 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
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PTPRMP28827 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
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PTPRMP28827 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
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PTPRMP28827 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
PTPRMP28827 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
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PTPRMP28827 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
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PTPRMP28827 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
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PTPRMP28827 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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PTPRMP28827 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
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PTPRMP28827 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
PTPRMP28827 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PTPRMP28827 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
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