Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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CLDN9O95484 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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CLDN9O95484 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CLDN9O95484 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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CLDN9O95484 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CLDN9O95484 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
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CLDN9O95484 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.01□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CLDN9O95484 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CLDN9O95484 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
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