Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.8 ms