Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms