Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
RTL8BQ17RB0 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
RTL8BQ17RB0 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms