Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SNRNP35Q16560 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNRNP35Q16560 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNRNP35Q16560 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.2 ms