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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
RNU6-988P-201
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107 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR8062-201
ENST00000621515
85 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
AP001340.1-201
ENST00000624405
217 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
SNORD114-3-201
ENST00000364969
75 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
RNY3P8-201
ENST00000411366
126 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
AC022559.1-201
ENST00000520905
205 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
MIR548V-201
ENST00000584165
80 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
SNCB
Q16143
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.630-201
ENST00000411370
108 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-982P-201
ENST00000516216
102 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-681P-201
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104 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.346-201
ENST00000365385
112 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-1081P-201
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107 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
MIR1236-201
ENST00000408340
102 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
MIR5009-201
ENST00000578736
100 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
MTND4P29-201
ENST00000503122
1372 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
SNORD1B-201
ENST00000363091
84 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.233-201
ENST00000364407
101 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.288-201
ENST00000364854
92 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.419-201
ENST00000384041
102 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
SNORD113-2-201
ENST00000391082
72 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-1094P-201
ENST00000362416
104 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-330P-201
ENST00000363015
107 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-669P-201
ENST00000365575
107 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.400-201
ENST00000383963
111 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.609-201
ENST00000410669
89 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.701-201
ENST00000516812
110 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
MIR3908-201
ENST00000579798
126 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
SNORA41B-201
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128 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
SNORD77.2-201
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68 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-995P-201
ENST00000391244
107 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-985P-201
ENST00000410182
104 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.216-201
ENST00000364205
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BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
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□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-974P-201
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BASIC
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SNCB
Q16143
RNU6-713P-201
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107 nt
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□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-887P-201
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BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.644-201
ENST00000459006
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BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
Y_RNA.705-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.81
SNCB
Q16143
RNU6-623P-201
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BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
SNORD63.2-201
ENST00000516303
64 nt
BASIC
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□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU7-151P-201
ENST00000516930
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BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-537P-201
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BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
MIR4795-201
ENST00000584182
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BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.647-201
ENST00000459194
112 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.640-201
ENST00000459296
112 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-523P-201
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54 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-875P-201
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106 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.803-201
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BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.815-201
ENST00000616655
112 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.795-201
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112 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.827-201
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BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.20-201
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-2.56
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.356-201
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113 nt
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-2.56
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.525-201
ENST00000384570
113 nt
BASIC
-2.56
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
MIR630-201
ENST00000384957
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BASIC
-2.56
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
ST7-OT3_3.1-201
ENST00000611709
115 nt
BASIC
-2.56
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-1020P-201
ENST00000363684
107 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.349-201
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102 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.420-201
ENST00000384043
110 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-604P-201
ENST00000390917
100 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-141P-201
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105 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-1135P-201
ENST00000411083
103 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.629-201
ENST00000411368
105 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-1108P-201
ENST00000516308
104 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
AP000770.2-201
ENST00000623694
100 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-694P-201
ENST00000364071
147 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-1064P-201
ENST00000410626
104 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
U7.2-201
ENST00000607576
63 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
-2.59
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
RNU6-574P-201
ENST00000384265
107 nt
BASIC
-2.59
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
TRAJ61-201
ENST00000390479
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.59
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
Y_RNA.778-201
ENST00000620203
90 nt
BASIC
-2.59
□□□□□ -2.82
SNCB
Q16143
MIRLET7A2-201
ENST00000362105
72 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
SNORA33.2-201
ENST00000365413
134 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
MIR579-201
ENST00000385221
98 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
U6.104-201
ENST00000637979
90 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
Y_RNA.240-201
ENST00000364469
95 nt
BASIC
-2.61
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
Y_RNA.398-201
ENST00000383952
99 nt
BASIC
-2.61
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
RNU6-635P-201
ENST00000516651
102 nt
BASIC
-2.61
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
MIR3675-201
ENST00000583661
73 nt
BASIC
-2.61
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
SNORD113-3-201
ENST00000364830
72 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
Y_RNA.291-201
ENST00000364886
113 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
RNU6-904P-201
ENST00000516206
101 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
SNCB
Q16143
RNU4-71P-201
ENST00000516258
113 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
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