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Protein–RNA interactions for Protein: Q15843
NEDD8, NEDD8, human
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RNA
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Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
Length
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Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
NEDD8
Q15843
AC022559.1-201
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205 nt
BASIC
-2.65
□□□□□ -2.83
NEDD8
Q15843
Y_RNA.29-201
ENST00000362570
113 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.325-201
ENST00000365171
122 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR548W-201
ENST00000581970
74 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR3170-201
ENST00000582699
77 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
SNORD115-31-201
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82 nt
BASIC
-2.67
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-795P-201
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103 nt
BASIC
-2.67
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR548C-201
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97 nt
BASIC
-2.68
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR1236-201
ENST00000408340
102 nt
BASIC
-2.68
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR5009-201
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100 nt
BASIC
-2.68
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR466-201
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84 nt
BASIC
-2.68
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.11-201
ENST00000362375
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BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-1111P-201
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107 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
U7.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
U2.18-201
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84 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-766P-201
ENST00000362478
107 nt
BASIC
-2.7
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.400-201
ENST00000383963
111 nt
BASIC
-2.7
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.705-201
ENST00000516862
110 nt
BASIC
-2.7
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-1267P-201
ENST00000410747
107 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.684-201
ENST00000516510
99 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
MIR3171-201
ENST00000584270
74 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
SNORD19B.1-201
ENST00000630615
80 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-682P-201
ENST00000363843
106 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.240-201
ENST00000364469
95 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.574-201
ENST00000384766
95 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-887P-201
ENST00000410660
100 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
snoU13.10-201
ENST00000459301
103 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.778-201
ENST00000620203
90 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
NEDD8
Q15843
Y_RNA.138-201
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102 nt
BASIC
-2.73
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
MIR513C-201
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
-2.73
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
Y_RNA.200-201
ENST00000364018
102 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU6-1283P-201
ENST00000365314
105 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
Y_RNA.420-201
ENST00000384043
110 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
Y_RNA.630-201
ENST00000411370
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
SNORD54-201
ENST00000459159
67 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
MTATP8P1-201
ENST00000467115
207 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU7-153P-201
ENST00000516455
62 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU6-1089P-201
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104 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
AC020661.2-201
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134 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
AC072026.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU6-698P-201
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107 nt
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU6-34P-201
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107 nt
BASIC
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NEDD8
Q15843
RNU6-1306P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
MIR548AA1-201
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BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
MT-TD-201
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU6-861P-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
AC013734.1-201
ENST00000619329
111 nt
BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
Y_RNA.478-201
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107 nt
BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
Y_RNA.525-201
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113 nt
BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
SNORD77.2-201
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BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
MIR1207-201
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
Q15843
RNU6-537P-201
ENST00000517277
103 nt
BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
ST7-OT3_3.1-201
ENST00000611709
115 nt
BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU6-1227P-201
ENST00000383981
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BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
TRAJ33-201
ENST00000390504
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.77
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
hsa-mir-4773-1.1-201
ENST00000585225
78 nt
BASIC
-2.77
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
Y_RNA.202-201
ENST00000364083
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
RNU4-40P-201
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BASIC
-2.78
□□□□□ -2.85
NEDD8
Q15843
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143 nt
BASIC
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□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
RNU6-111P-201
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105 nt
BASIC
-2.79
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-2.79
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.509-201
ENST00000384506
99 nt
BASIC
-2.8
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
MIR548F4-201
ENST00000408515
105 nt
BASIC
-2.8
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
MIR548V-201
ENST00000584165
80 nt
BASIC
-2.8
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
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□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
-2.81
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.264-201
ENST00000364665
102 nt
BASIC
-2.81
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
MIR548X2-201
ENST00000579776
100 nt
BASIC
-2.81
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
MTRNR2L9-201
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75 nt
BASIC
-2.81
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.96-201
ENST00000363092
109 nt
BASIC
-2.82
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
-2.82
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.702-201
ENST00000516843
96 nt
BASIC
-2.82
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.804-201
ENST00000615262
101 nt
BASIC
-2.82
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.580-201
ENST00000391004
95 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
RNA5SP93-201
ENST00000362525
114 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.459-201
ENST00000384251
102 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
MIR3128-201
ENST00000581957
66 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
NEDD8
Q15843
Y_RNA.350-201
ENST00000365409
98 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
RNU6-1081P-201
ENST00000384537
107 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
RNU6-982P-201
ENST00000516216
102 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
Y_RNA.680-201
ENST00000516441
93 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
AL157777.2-201
ENST00000258070
137 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
Y_RNA.649-201
ENST00000459077
103 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
RNU6-1023P-201
ENST00000516137
106 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
RNU6-904P-201
ENST00000516206
101 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
U6.97-201
ENST00000636904
101 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
NEDD8
Q15843
RNU6-574P-201
ENST00000384265
107 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
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