Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PKP1Q13835 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKP1Q13835 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PKP1Q13835 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
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PKP1Q13835 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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PKP1Q13835 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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PKP1Q13835 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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PKP1Q13835 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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