Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
APOFQ13790 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
APOFQ13790 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
APOFQ13790 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
APOFQ13790 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
APOFQ13790 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
APOFQ13790 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
APOFQ13790 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
APOFQ13790 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
APOFQ13790 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
APOFQ13790 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
APOFQ13790 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
APOFQ13790 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
APOFQ13790 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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APOFQ13790 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
APOFQ13790 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
APOFQ13790 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
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APOFQ13790 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
APOFQ13790 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
APOFQ13790 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
APOFQ13790 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
APOFQ13790 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
APOFQ13790 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
APOFQ13790 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
APOFQ13790 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
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APOFQ13790 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
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APOFQ13790 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
APOFQ13790 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
APOFQ13790 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
APOFQ13790 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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APOFQ13790 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
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APOFQ13790 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
APOFQ13790 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
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APOFQ13790 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
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APOFQ13790 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
APOFQ13790 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
APOFQ13790 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
APOFQ13790 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
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