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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
RNU6-766P-201
ENST00000362478
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-924P-201
ENST00000362926
108 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-340P-201
ENST00000364005
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
Y_RNA.365-201
ENST00000365537
102 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-109P-201
ENST00000516364
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-589P-201
ENST00000516485
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-184P-201
ENST00000516514
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
MIR3671-201
ENST00000580455
88 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-681P-201
ENST00000364012
104 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU7-153P-201
ENST00000516455
62 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
Y_RNA.190-201
ENST00000363964
101 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
Y_RNA.544-201
ENST00000384650
113 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
TRAJ61-201
ENST00000390479
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
AL031386.1-201
ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-774P-201
ENST00000363238
107 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
MIR519C-201
ENST00000385053
87 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-706P-201
ENST00000517229
104 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
SNORD115-27-201
ENST00000364430
82 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
SNORA19-201
ENST00000384737
128 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
SNORD77.2-201
ENST00000391045
68 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU7-134P-201
ENST00000458997
64 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
RNU6-162P-201
ENST00000516228
103 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
MIR3668-201
ENST00000582138
75 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL1
Q13616
Y_RNA.264-201
ENST00000364665
102 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
Y_RNA.290-201
ENST00000364879
114 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-479P-201
ENST00000516348
105 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
AL365222.1-201
ENST00000614661
98 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
MIR6129-201
ENST00000616087
109 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
AL021921.1-201
ENST00000442774
93 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
AC138207.3-201
ENST00000585289
166 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
MIR2052-201
ENST00000636055
55 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
AC132825.6-201
ENST00000638861
357 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
SNORD115-33-201
ENST00000363723
82 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-1056P-201
ENST00000383996
107 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
MIR519A2-201
ENST00000384990
87 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
SNORA26.4-201
ENST00000391188
123 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
snoU13.19-201
ENST00000459148
104 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-633P-201
ENST00000362612
103 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-1168P-201
ENST00000390831
104 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
AL035461.1-201
ENST00000421490
332 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
TMSB4XP3-201
ENST00000445144
114 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
MIR29B1-201
ENST00000385015
81 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
Y_RNA.613-201
ENST00000410726
97 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-624P-201
ENST00000363411
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-30P-201
ENST00000384561
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
MIR8485-201
ENST00000401372
91 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
RNU6-518P-201
ENST00000516056
96 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
FAS-AS1.1-201
ENST00000615327
126 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
LEKR1-212
ENST00000640869
237 nt
TSL 5
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL1
Q13616
SNORD63.1-201
ENST00000516178
80 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
Y_RNA.709-201
ENST00000516952
92 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-1233P-201
ENST00000362922
102 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
SNORD115-37-201
ENST00000363768
82 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-22P-201
ENST00000384355
107 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-656P-201
ENST00000516785
107 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
MIR4668-201
ENST00000582284
70 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
Y_RNA.178-201
ENST00000363832
102 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-1117P-201
ENST00000384525
104 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-807P-201
ENST00000516805
107 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
MIR6818-201
ENST00000621576
65 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
ULK3-223
ENST00000631115
126 nt
TSL 5
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNA5SP476-201
ENST00000516613
103 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-557P-201
ENST00000516842
110 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
112 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU2-51P-201
ENST00000410708
197 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
Y_RNA.620-201
ENST00000411009
88 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
AL353795.2-201
ENST00000431804
425 nt
TSL 2
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
AL031737.1-201
ENST00000450125
223 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
AC093729.1-201
ENST00000513074
128 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
U2.7-201
ENST00000619197
100 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-576P-201
ENST00000390854
102 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU4-61P-201
ENST00000411243
107 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
RNU6-1108P-201
ENST00000516308
104 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL1
Q13616
SNORD115-22-201
ENST00000364456
82 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR889-201
ENST00000401280
79 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
Y_RNA.348-201
ENST00000365403
103 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR527-201
ENST00000385244
85 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
Y_RNA.583-201
ENST00000391033
113 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
AL353691.2-201
ENST00000443795
59 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR4320-201
ENST00000636981
65 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-226P-201
ENST00000363778
107 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-219P-201
ENST00000364728
107 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
Y_RNA.495-201
ENST00000384435
112 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNA5SP461-201
ENST00000516451
104 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNA5SP26-201
ENST00000362406
119 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-645P-201
ENST00000364649
106 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
SNORD116-22-201
ENST00000384430
92 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MT-TR-201
ENST00000387439
65 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR548M-201
ENST00000408260
86 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-732P-201
ENST00000516033
103 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-303P-201
ENST00000517091
106 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
AP001318.4-201
ENST00000616637
121 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-246P-201
ENST00000384702
107 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
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