Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.5□□□□□ -2.97
ATMQ13315 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ATMQ13315 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ATMQ13315 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ATMQ13315 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ATMQ13315 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ATMQ13315 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
ATMQ13315 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-3.56□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
ATMQ13315 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-3.56□□□□□ -2.98
ATMQ13315 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ATMQ13315 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ATMQ13315 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ATMQ13315 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ATMQ13315 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ATMQ13315 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ATMQ13315 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ATMQ13315 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ATMQ13315 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ATMQ13315 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
ATMQ13315 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
ATMQ13315 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ATMQ13315 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ATMQ13315 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ATMQ13315 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.66□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ATMQ13315 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ATMQ13315 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ATMQ13315 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ATMQ13315 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ATMQ13315 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ATMQ13315 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ATMQ13315 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
ATMQ13315 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.69□□□□□ -3
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