Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IFT88Q13099 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
IFT88Q13099 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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IFT88Q13099 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
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IFT88Q13099 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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IFT88Q13099 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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IFT88Q13099 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
IFT88Q13099 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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IFT88Q13099 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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IFT88Q13099 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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IFT88Q13099 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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IFT88Q13099 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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IFT88Q13099 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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