Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms