Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
CENPFP49454 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
CENPFP49454 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-5.49□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
CENPFP49454 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
CENPFP49454 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
CENPFP49454 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
CENPFP49454 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC-5.5□□□□□ -3.29
CENPFP49454 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
CENPFP49454 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
CENPFP49454 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
CENPFP49454 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
CENPFP49454 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
CENPFP49454 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
CENPFP49454 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
CENPFP49454 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
CENPFP49454 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
CENPFP49454 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
CENPFP49454 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
CENPFP49454 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
CENPFP49454 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
CENPFP49454 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
CENPFP49454 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
CENPFP49454 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
CENPFP49454 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
CENPFP49454 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
CENPFP49454 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
CENPFP49454 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
CENPFP49454 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
CENPFP49454 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
CENPFP49454 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
CENPFP49454 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
CENPFP49454 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
CENPFP49454 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
CENPFP49454 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
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CENPFP49454 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
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CENPFP49454 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
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CENPFP49454 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
CENPFP49454 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
CENPFP49454 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
CENPFP49454 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
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CENPFP49454 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
CENPFP49454 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-5.7□□□□□ -3.32
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CENPFP49454 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
CENPFP49454 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
CENPFP49454 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
CENPFP49454 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
CENPFP49454 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
CENPFP49454 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
CENPFP49454 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
CENPFP49454 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-5.75□□□□□ -3.33
CENPFP49454 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
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