Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRMP28827 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
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PTPRMP28827 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRMP28827 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRMP28827 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
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PTPRMP28827 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
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PTPRMP28827 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
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PTPRMP28827 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
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PTPRMP28827 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRMP28827 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
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