Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CLDN9O95484 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CLDN9O95484 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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CLDN9O95484 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CLDN9O95484 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
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CLDN9O95484 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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CLDN9O95484 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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CLDN9O95484 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CLDN9O95484 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CLDN9O95484 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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