Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms