Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D7E4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms