Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms