Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BccipQ9CWI3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms