Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms