Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmp1Q99KU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms