Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atpaf2Q91YY4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atpaf2Q91YY4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms