Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApobrQ8VBT6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms