Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ercc8Q8CFD5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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